La Collezione di Anatomia comparata e Zoologia è stata iniziata nel 1989 grazie al lavoro del personale e degli studenti dell'Università della Tuscia. Ogni Anno Accademico si è arricchita di preparati anatomici di animali vertebrati e invertebrati. Il materiale è stato inizialmente selezionato e preparato ai fini didattici per gli studenti del corso di biologia, affinchè potessero trasferire le conoscenze acquisite dal docente e dai libri alla pratica di laboratorio. Successivamente, data la quantità di materiale disponibile, si è pensato di destinarne una parte per l'allestimento di uno spazio museale. I materiali della Collezione provengono da scambi, campionamenti realizzati durante spedizioni scientifiche, donazioni da parte di musei, donazioni di studiosi. La Collezione comprende scheletri di vertebrati, animali impagliati, preparati in secco di invertebrati, vertebrati e invertebrati conservati in barattoli di vetro, oltre a modellini di organi e animali. La Collezione di Anatomia comparata e Zoologia fa parte del Sistema Museale di Ateneo dell'Università della Tuscia
Nell’ambito della mostra permanente del Sistema Museale di Ateneo il 17 luglio 2015 è stata inagurata la sezione di Anatomia Comparata e Zoologia e quella dello Xyarium, dove sono stati esposi alcuni esemplari che ricostruiscono l’ambiente del bosco (figura a fianco).
| Falco della palude | Barbagianni | Falco Pecchiaiolo | Pipistrello |
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| Biscia dal collare | Talpa | Topo comune | Tartarughe |
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| Rospo | Toporagno | Scorpioni | Ragni |
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| Larve di farfalla | Cavallette |
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| Vipera | Lucertola muraiola | Biscia |
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| Talpa | Volpe | Istrice | Cinghiale |
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